במהלך שנת הלימודים התלמידים מקבלים חיסונים בהתאם למפת שגרת החיסונים המומלצת במדינת ישראל. השנים האחרונות היוו אתגר משמעותי למערכת הבריאות במתן השירותים במסגרת בית הספר עקב סגרים, בידודים, היעדרויות ומצבים חריגים נוספים.
על מנת לאפשר לכל תלמיד ותלמידה להשלים את סדרת החיסונים, אחיות בריאות התלמיד עושות כל מאמץ לאתר תלמידים שלא קיבלו את החיסון אליו היו מועמדים הן בשנת לימודים הנוכחית והן בשנים קודמות כולל גיל הינקות.
השלמת חיסונים שלא ניתנו מכל סיבה שהיא עשויה להקנות לתלמידים את ההגנה הנדרשת מפני מחלות זיהומיות קשות ולמנוע התפרצויות. לבירור סטטוס ההתחסנות של התלמיד וקביעת ההשלמה יש ליצור קשר עם אחות בית הספר או מוקד בריאות התלמיד.