תסמיני השפעת יופיעו לרוב בצורה פתאומית וללא כל סימנים מקדימים. בין תסמיני המחלה הנפוצים ניתן למנות חום גבוה, שיעול יבש, נזלת, כאבי גרון, תשישות, כאבי שרירים וכאבי ראש. בנוסף, המחלה עלולה לגרום גם לבעיות בקיבה ולשלשול. השיעול עלול להיות חמור ולהימשך שבועיים ואף יותר.

מחלת השפעת עלולה להוביל גם לתחלואה קשה ואף למוות. לרוב, תחלואה קשה תופיע בקרב קבוצות סיכון – בראשן מבוגרים מעל גיל 65. ברחבי העולם גורמת השפעת בכל שנה לכ-3-5 מיליון מקרי תחלואה קשה ובין 290,000 ל-650,000 מקרי מוות. בעולם המתפתח השפעת גורמת בתדירות גבוהה למקרי מוות בקרב ילדים מתחת לגיל 5.

גם נשים בהיריון נמצאות בסיכון מוגבר לתחלואה קשה כתוצאה משפעת – ומסיכון גבוה להתאשפז בבית חולים או להגיע לטיפול נמרץ. כתוצאה מכך, המחלה עלולה לגרום גם לנזקים לתינוק.